Natamycin có tác dụng ức chế mạnh đối với nấm mốc, nấm men và nấm nhưng không có tác dụng ức chế vi khuẩn, vi rút và các vi sinh vật khác. Nó được sử dụng rộng rãi trong phô mai, các sản phẩm thịt, bánh ngọt, nước trái cây và các thực phẩm khác trên toàn thế giới.